实时荧光定量 PCR 仪如何检测肉类微生物

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实时荧光定量 PCR 仪检测肉类微生物主要基于聚合酶链式反应(PCR)技术,并结合荧光检测方法,能够对肉类中的微生物进行定性和定量分析,具体操作步骤如下:
样品采集与处理:从肉类样品的不同部位采集适量样本,放入无菌容器中。将采集的样品进行均质处理,使微生物均匀分散在溶液中。然后采用合适的核酸提取方法,如试剂盒法,从样品中提取微生物的核酸(DNA 或 RNA)。对于 RNA 病毒等含 RNA 的微生物,还需要进行逆转录过程,将 RNA 转化为 cDNA。
引物和探针设计:根据目标微生物的特定基因序列,设计特异性的引物和荧光探针。引物是一段短的 DNA 序列,能够与目标基因的两端互补配对,引导 DNA 聚合酶进行扩增;荧光探针则是一段与目标基因中间部分互补的寡核苷酸,两端分别标记有荧光报告基团和淬灭基团。当探针完整时,荧光报告基团发出的荧光被淬灭基团吸收;而当探针被降解时,荧光报告基团与淬灭基团分离,发出荧光。
配制反应体系:在 PCR 反应管中依次加入适量的模板核酸(提取的微生物核酸或 cDNA)、引物、荧光探针、DNA 聚合酶、dNTPs(脱氧核苷三磷酸)、缓冲液等,组成 PCR 反应体系。确保各成分的浓度和比例合适,以保证 PCR 反应的顺利进行。
设置反应条件:将 PCR 反应管放入实时荧光定量 PCR 仪中,设置合适的反应程序。一般包括预变性步骤,使 DNA 双链解开;然后进行多个循环的变性、退火和延伸步骤。变性是使 DNA 双链分离,退火是让引物与模板 DNA 结合,延伸是在 DNA 聚合酶的作用下合成新的 DNA 链。在每个循环的延伸阶段,荧光探针会被 DNA 聚合酶降解,释放出荧光信号,实时荧光定量 PCR 仪会实时监测荧光信号的强度。
数据分析与结果判断:随着 PCR 反应的进行,荧光信号会逐渐增强。实时荧光定量 PCR 仪会自动记录每个循环的荧光值,并生成扩增曲线。通过分析扩增曲线的 Ct 值(循环阈值,即荧光信号达到设定阈值时所经历的循环数),可以对目标微生物进行定性和定量分析。一般来说,Ct 值越小,说明样品中目标微生物的核酸含量越高。同时,通过与已知浓度的标准品的扩增曲线进行比较,还可以计算出样品中目标微生物的具体数量。如果样品的扩增曲线呈现典型的 S 型曲线,且 Ct 值在合理范围内,则判定样品中存在目标微生物;如果没有扩增曲线或 Ct 值大于设定的阈值,则判定样品中不存在目标微生物或微生物含量低于检测限。
实时荧光定量 PCR 仪检测肉类微生物具有灵敏度高、特异性强、检测速度快等优点,能够快速准确地检测出肉类中可能存在的致病菌、腐败菌等微生物,为肉类食品安全提供有力保障。
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