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实时荧光定量PCR仪检测肉类微生物的具体实验步骤有哪些?

发布者:超级管理员 2025-03-19

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        实时荧光定量 PCR 仪检测肉类微生物的具体实验步骤如下:

        样品准备

        采样:使用无菌工具从不同部位采集适量的肉类样品,放入无菌容器,防止样品被外源微生物污染。例如,对于一块生鲜肉,可从其表面、内部不同位置多点取样。

        均质:将采集的肉类样品剪碎后,放入无菌均质袋,加入适量无菌生理盐水或缓冲液,用均质器均质,使微生物充分释放到液体中。

        核酸提取:采用核酸提取试剂盒进行操作。根据试剂盒说明书,取适量上述均质液,经过细胞裂解、核酸结合、洗涤去除杂质、洗脱等步骤,提取微生物的核酸(DNA 或 RNA)。若检测的目标微生物为 RNA 病毒等含 RNA 的种类,需用逆转录试剂盒将提取的 RNA 逆转录为 cDNA。

        引物和探针设计与准备

        设计:依据目标微生物的特异性基因序列,借助生物信息学软件设计特异性引物和荧光探针。引物应能特异性结合目标基因的两端,探针则与目标基因中间某段序列互补,且两端分别标记荧光报告基团(如 FAM、VIC 等)和淬灭基团(如 TAMRA 等)。

        合成与溶解:将设计好的引物和探针交由专业公司合成,收到后用无菌无核酸酶水溶解,配制成合适浓度的储存液,如 10 μmol/L,于 - 20℃保存。

        配制反应体系

        在无菌的 PCR 反应管中依次加入以下成分(以 20 μL 反应体系为例):

        2×PCR 反应预混液 10 μL(包含 DNA 聚合酶、dNTPs、缓冲液等)。

        上游引物(10 μmol/L)0.5 μL。

        下游引物(10 μmol/L)0.5 μL。

        荧光探针(10 μmol/L)0.5 μL。

        模板核酸(提取的 DNA、cDNA)2 μL。

        用无菌无核酸酶水补齐至 20 μL。

        轻轻混匀反应管内的液体,短暂离心,使液体集中于管底。

        设置反应程序

        将配制好的反应管放入实时荧光定量 PCR 仪中,设置以下反应程序(不同目标微生物和试剂可能略有差异):

        预变性:一般为 95℃,持续 3-5 分钟,使 DNA 双链充分解开。

        循环反应:例如 95℃变性 15 秒,使 DNA 双链再次分离;60℃退火和延伸 60 秒,在这个过程中引物与模板结合,DNA 聚合酶催化新链合成,同时荧光探针被降解,释放荧光信号。通常进行 40 个循环。

        数据采集与分析

        在 PCR 反应过程中,实时荧光定量 PCR 仪会实时监测每个循环的荧光信号强度,并自动记录数据。

        反应结束后,仪器软件会生成扩增曲线和 Ct 值(循环阈值)。Ct 值是指荧光信号达到设定阈值时所经历的循环数。

        通过与已知浓度的标准品的扩增曲线和 Ct 值进行比较,构建标准曲线。根据样品的 Ct 值,从标准曲线上计算出样品中目标微生物的核酸含量,进而推断微生物的数量。如果样品的 Ct 值小于设定的阈值且扩增曲线呈典型的 S 型,则判定样品中存在目标微生物;若 Ct 值大于阈值或无扩增曲线,则判定样品中不存在目标微生物或微生物含量低于检测限。

        以上就是实时荧光定量 PCR 仪检测肉类微生物的详细实验步骤,实验过程中需严格遵守无菌操作和实验室安全规范,以确保结果的准确性和可靠性。

        

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